１． 歴史の中の科学；
歴史の中で、ルネサンスから啓蒙・科学の時代に入り、長い間混沌としていた雑多な現象に科学の光が差し、天文・物理や化学の諸法則が次々と再発見されて行きました。ここで、なぜ再発見かと言うと、それらの多くはすでに古代ギリシャや、はるか昔の古代バビロニアの時代に見出されるからです。さらに、いわゆるノアの洪水（Ｂ．Ｃ．２０００年頃）以前にも、いくつかのオーパーツとしての証拠が物語るように、現代文明と同様なものが作られていたと思われます。
｢｢これを見よ。これは新しい。｣と言われるものがあっても、それは、私たちよりはるか先の時代に、すでにあったものだ。・・・｣ （伝道者の書1-10）
中世のキリスト教支配の時代に、社会の影に隠れた魔術師・占星術師・錬金術師たちは一獲千金を夢見てか、あるいはキリスト教支配に反抗してか、とにかく科学の元となるいろいろな現象に接していましたが、彼らは秘密主義かつ経験主義で、それらを統一的にまとめようとはしなかったので、一般的に成り立つ法則としての実を見ることはなかったのです。確かに、当時のキリスト教会はイエスキリストや使徒の時代（原始キリスト教の時代）とは異なり、偽りを含む形できわめて行き過ぎており、また、政治と結託して堕落していました。したがって、とても、科学的な真理を追究できる環境ではなかったのです。
その後、王族や貴族の道楽の為に雇われた学者達が次々と物質や法則を発見して行きました。
そして、偽のミステリアスな現象はことごとく見破られ、あるいは、啓蒙され、人を惑わす魔術などはすたれていったのです。
心理的に見ると、何かわからないものや目新しいものは、興味を引くと同時に不安を引き起こし、ねじ曲がった情報を受け入れやすくします。聖書の奥義によれば、実は、この不安定な心のすきまに惑わしの悪霊が働くことがあると言われています。星占いやタロット占いなどをやってロクなことが無かったでしょう。わからないことは明らかにされて行くべきものであり、”常”がわかって初めて”異常”がわかるものです。
科学的現象も、一定の法則や規則性がわかって初めて科学になり得ます。また、科学的な常識や態度があって初めて、偽物と、本当の異常な現象とが区別できるようになります。したがって、科学の学習はむなしいものに捕われない為の予防接種であるという重要な意味があります。さらに、もし、本当に奇跡の要素があれば、まず、普通に起こり得る事を適正に判断して、その上で、奇跡というものを正しく認識できるのです。
ヨーロッパ合理主義の流れ
近代から現代にかけては、歴史の流れからすると、わずか数世紀の間に非常に急速に産業・経済が発達し、機械文明になってゆきました。その流れの中で、科学的方法論も、科学的知識も、それらの根底を支えるものとして、非常な勢いで発達しました。これ自体は大変役に立つすばらしい恵みであると考えられます。 （大別して、物理、化学（軌道電子の物理）、生物（含・動物学、植物学）、地学（天文、地球物理、地質・鉱物、海洋）、数学、コンピュター。）
しかしながら、出来上がってきた科学には、真理よりも権威主義的な体制を重んじる為、あるいは、社会に混乱を起こさないようにするという政治的な動機で、真理が曲げられ、それが科学的常識になってしまったものが含まれているのです。（進化論、（強い）コペンハーゲン解釈、ビッグバン宇宙論など）
そして、この宇宙や物質や生命が、非常に長い時間をかけて自然発生的に生成する思想（神なき世界観）、また、人の意識あるいは自然との総合体が宇宙の動向を決定する（人が神になる世界観）ような思想すら定着してしまいました。